当时各旗的旗主分别是：正黄旗主和镶黄旗主爱新觉罗·努尔哈赤、
正红旗主和镶红旗主爱新觉罗·代善、
正白旗主爱新觉罗·皇太极、
镶白旗主爱新觉罗·杜度、
正蓝旗主爱新觉罗·莽古尔泰、镶蓝旗主爱新觉罗·阿敏。
八旗建立自此始，亦即为满洲八旗的源起。因此清朝八旗旗主的姓氏都是爱新觉罗。
入关前，八旗中的正黄、镶黄两旗由汗王（皇帝）直接统领，其它6旗分别由汗王的子侄统领。顺治八年（1651年）多尔衮死，顺治帝亲政，收多尔衮所辖的正白旗归皇帝统领，于是形成了上三旗与下五旗。
清朝八大旗对应姓氏 扩展
满清八旗姓氏分别是佟(佟佳氏)，关(瓜尔佳氏)，马(马佳氏)，索(索绰罗氏)，赫(赫舍里氏)，富(富察氏)，那(那拉氏)，郎(钮祜禄氏)八姓。八旗演化出了八大姓氏，原本他们的姓氏多是复姓，由两个以上的汉字组成，不过现在已经慢慢的简化成一个字了，如果了解这些姓氏的话，你见到满族人的时候就能从对方的名字中得知他们的地位高低，他们就是郎、佟、那、富、齐、索、马和关，越靠前地位越高。
清朝八大旗对应姓氏 扩展
分别是佟（佟佳氏），关（瓜尔佳氏），马（马佳氏），索（索绰罗氏），赫（赫舍里氏），富（富察氏），那（那拉氏），郎（钮祜禄氏）八姓，俗呼"满洲八大姓"。
